1967年,出生在台湾省台北市的一个体育世家,从小特别喜欢打篮球。1979年,担任女子篮球队的职业前锋,打了三年篮球。1982年,在篮球场打球时,一位广告商被她的气质所吸引。随后,对方邀请王祖贤拍摄了一部化妆品的广告片。该广告片播出后,王祖贤由此产生继续学习表演艺术的愿望。初中毕业后,考入国光剧艺实验学校系统地学习表演的专业知识。
1987年,因拍摄电影《芳草碧连天》与歌手齐秦相恋。1993年,王祖贤向齐秦提出分手,与商人林建岳发展出婚外情。1996年,双方分手；随后与齐秦复合。1998年,齐秦王祖贤双方在台北市购买房屋准备结婚。2003年,齐秦的前妻要求对方认养儿子,两人分手。
1993年,王祖贤寻根祭祖后,在安徽老家舒城县石岗镇捐资10万元港币修建了当地第一条柏油马路；1月,参加电影《射雕英雄传之东成西就》的慈善义演；6月,出席台湾反毒公益活动。