威尼斯拍片1998年,吴佩慈推出了《AllMyPace》,《Pace》和《挑剔》三张专辑。2002年,她出演了电视剧《流星花园Ⅱ》。2005年3月,她出版自己首本美容书《美丽达人》；4月,她推出了专辑《LookAtMe》；12月,吴佩慈获得“芭比奖”,成为首位获此殊荣的中国台湾女艺人,这也是华人首次获奖。同年,她还获得了腾讯风尚星光大道奖。吴佩慈2007年,吴佩慈出席了东方卫视明星秀《劳动最光荣》发布会并参与第一期节目的录制。同年7月,吴佩慈在“2007粤港十年网娱盛典”颁奖晚会上获颁最具风情女艺人奖。同年12月,她被《风度》杂志评为年度最具人气封面女星。2008年,吴佩慈作为主持人登上央视中秋晚会的舞台。10月,她发行EP《夜光航线》。辑中共收录了四首歌曲,都是描写恋爱中女人的心情。12月,吴佩慈出演了吴镇宇执导的电影《追影》,并在影片中担任女主角。吴佩慈2009年,吴佩慈出演了程珑导演处女作《终极匹配》；3月,她作为“娱乐庆典十周年”代言人出席此次活动；8月,她正式宣布加盟了徐静蕾执导的《杜拉拉升职记》,演绎都市女白领；11月,她出演的《熊猫大侠》上映,它在这部电影中首次尝试了颠覆自己已往形象的表演。2010年4月,她主演的电影《预审》上映。6月12日,她踏上了上海电影节的星光大道,这也是她主演的《剑雨》首次正式亮相。9月,她主演的《密室之不可告人》首曝造型照,影片于10月29日上映,3天全国票房近千万元。2013年3月,吴佩慈亮相巴黎秋冬时装周Carven专场秀。4月12日,吴佩慈出演的治愈系浪漫爱情电影《分手合约》上映,影片上映10天累计票房已超过1.45亿。8月9日,她出演的性感喜剧《一夜惊喜》上映。2014年11月13日,13日她受邀出席活动。她在活动上宣布“将全面退出演艺圈”。
2008年11月,吴佩慈与马来西亚籍富商PeterChen在飞机上相识,之后开始交往。2011年,吴佩慈与PeterChen分手。2013年9月,吴佩慈透漏自己怀孕4个月,孩子爸爸是纪晓波。2014年2月17日中午12点,在香港剖腹生下女儿,小名“小蕊蕊”,英文名“Hillary”,希望宝贝千金看齐美国政坛女强人希拉里的聪慧,坚强,勇敢。2015年6月1日,吴佩慈在脸书晒出超音波照,证实怀了第二胎。11月17日下午2时许,在香港剖腹产下第二胎儿子Hans,她预产期原本是定于月底,但为了选在好日子出生,决定提前剖腹。2017年6月22日,吴佩慈的第三个孩子——儿子Hudson诞生。2020年1月31日,吴佩慈大方承认生女喜讯,称在1月13日于香港产下摩羯座女宝宝,小名Hailey,身高48公分,重2700克。
吴佩慈写真2008年,吴佩慈积极响应“2008发现中国式美丽”大型公益活动。该活动面向全国摄影家和摄影爱好者征集作品。征集的作品将以“中国式美丽”为创作理念,以女性人物为主题,结合人文景观与自然风光,表现生活中美丽,幸福的瞬间。12月,吴佩慈推出的《吴佩慈-爱遍中国爱心纪念邮票》上市,向世人发出爱心召唤,呼吁各界参与爱遍中国助学助教。
吴佩慈的漂亮好身材是圈里圈外人有名的,她有的1：9身材比例,又有丰满有致的女人曲线,还有靓丽的肌肤,常被称为“九头身美女”,“芭比娃娃”。同时,她又有着充满智慧,理性思考的一面。吴佩慈很像邦女郎,动作都很利落,很有韵味,能很快进入角色,而且能吃苦。