《以青春的名义》剧照2015年,与杨千嬅,林海峰,苏丽珊,游学修领衔主演青春校园电影《哪一天我们会飞》,在片中饰演踏实寡言且才华横溢的苏博文,这是他的首部电影作品,从而正式进入演艺圈,该片在香港上映期间票房突破了1千万港币,而他则凭借该片获得第22届香港电影评论学会大奖最佳男演员奖的提名。2016年1月2日,其主演的剧情电影《从缺》上映,在片中饰演男主角蔡继从；同年,与曾志伟,余文乐,金燕玲合作出演剧情电影《一念无明》,在片中饰演大海的邻居Hin。2017年,与古天乐,刘青云,姜皓文,胡子彤共同出演科幻动作电影《明日战记》；同年,与刘嘉玲,谢君豪合作主演青春爱情电影《以青春的名义》,在片中饰演男主角张子行；10月31日,出席“香港亚洲电影节2017”开幕礼。2022年,参演电影《还是觉得你最好》。
吴肇轩是一个性格十足的演员,他很像年轻时候的梁朝伟,他的眼神里面充满了一种被人怜爱的感觉。吴肇轩的演技很好,在电影《以青春的名义》中,完全没有跳舞底子的吴肇轩通过恶补排练,将泳池边跳舞的戏份演绎得出乎意料的好,他也因此被称赞有舞蹈天分；而在拍摄掌掴戏时,通过数十次的反复真打,也体现了他非常专业的一面。此外,吴肇轩在电影《哪一天我们会飞》中的表现也令人眼前一亮。